ウェブテクノロジユーザーサポートです。
貴重なご意見ありがとうございます。
本機能を使用しているユーザー様もいらっしゃいますので
それぞれのユーザー様の状況も含め、検討してまいります。
ファイル削除につきましては警告ダイアログを表示しております。
表示されない場合は、環境設定の「プロジェクト」>「ファイルを削除する前に確認を行う」にチェックを入っているかをご確認ください。
また、同項目にございます「取り消しができない操作を実行する前に確認を行う」にチェックをいれていただきますと、取り消しができない操作の前に警告ダイアログが表示されます。
尚、Ver.5.7まではファイルは消去されておりましたが
Ver.5.8からは削除後、ゴミ箱へ移動するようになっております。