ウェブテクノロジ 瀬良です。
大変ご迷惑をおかけしており申し訳ございません。
■考えられる要因
まず、このメッセージが出る要因としまして、
セルマップファイル(ssce) 内に記録されている参照イメージのファイルパス (imagePath) が絶対パスの際に、参照イメージの基準フォルダを起点にした相対パスに変換した時、になります。
絶対パスになっている条件は、
1. sspj と ssce ファイルが存在しているドライブが異なる。
2. TexturePacker で作成した ssce をプロジェクトに登録している。
が考えられます。
（たっち様は過去の質問にてTexturePackerに関してご投稿いただきましたので
２でしょうか？）
ご報告いただいた現象なのですが、
相対パスへの変換処理が上手くいっておらず、参照イメージ(テクスチャアトラス)が存在しない場所を指して読み込みエラーになっているのではないかと推察しております。
なお、6.2.2 → 6.3.1 にて、こちらの処理の変更は見つからなかったため、バージョン違いは関係ないと思われます。
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参照イメージ（テクスチャアトラス）のファイルパスなど確認、解決方法を調査するため
以下を SpriteStudioTechSupport@webtech.co.jp までお送りいただけないでしょうか。
■１ 再現データ
<imagePath> was converted to relative pathというエラー表示が出る 時点のファイル一式(sspj, ssce, ssae)
■２ 情報
A. sspj ファイル、ssceファイル、画像ファイル、それぞれの保存場所は、同じフォルダ内でしょうか？
異なる場合はそれぞれがどのファイルパス(例) /Macintosh HD/ユーザ/hoge/)にあるかお知らせください。
B. TexturePacker・PSDtoSSをご利用の場合、 それらのご利用バージョンをお知らせください。
C. エラー発生の前後の状況を知るためログファイルをお送りください。
▼SpriteStudioのログファイル・環境設定ファイルの場所は、 メインメニューのヘルプから「ログファイルの場所を開く」を選択することで開くことができます。 開いた場所にある「SpriteStudio.log」「SsOption_v6.ssop（もしくはSsOption.ssop）」をコピーしてお送りください。 http://www.webtech.co.jp/help/ja/spritestudio/guide/tips/access_violation/#contact_us
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以上になります。
大変ご迷惑をおかけしている中、重ね重ね恐れ入りますが
何卒よろしくお願いいたします。
