お世話になっております。
SS5/6Player for Unity担当です。
大変申し訳ございません。
SS5Player for Unity(以降SS5PU)はSpriteStudio5上でアニメーションのソート基準を「Z座標」に設定したデータには対応しておりません。
※また、現在SS5PUは開発を終了しており・SS6Player for Unityに移行しているため、今後に拡張する予定もございません。
この仕様は、SS5PUの最初からの仕様でしたため、GitHubのドキュメントに記載していた記憶があるのですが……今すぐに該当するページがみつからないので、同内容でのGitHubのIssueへのリンクを貼らせていただきます。
https://github.com/SpriteStudio/SS5PlayerForUnity/issues/172
ですので、SS5Player for Unityでデータを表示する用途の場合、アニメーションのソート基準は優先度の設定にしていただけますようお願いいたします。
何卒今後ともよろしくお願いいたします。